自第十一次党代会以来，我校顺利实施“十五”“211工程”和“985工程”一期、二期建设，学校的学科综合实力进一步得到显著增强。以国家、省部级研究基地建设为依托，构建了7个一、二级科技创新平台和2个省部级社科基地，完成“985工程”二期阶段性验收。

        学科建设是高校全面发展的基础与核心工作，是创建研究型大学的重中之重。学校注重整合学科资源，推动学科的交叉融合，加快新兴学科、交叉学科、应用学科的发展步伐，已基本形成了以高水平的理工学科为主体，新兴学科和交叉学科占相当比重，理工学科与管理、经济、人文、社会科学学科协调发展，与国家和地区产业结构调整相适应，优势突出、特色鲜明的学科体系。学科总体水平处于国内重点大学前列，若干个学科达到或接近世界先进水平。在2005－2006年的《中国研究生教育评价报告》中，学校的数学、力学、土木工程、化学工程与技术、管理科学与工程等5个一级学科在全国同类学科中处于重点优势学科地位，属于排在前5%的培养单位；机械工程、水利工程、材料科学与工程等13个一级学科处于优势学科地位，属于排在前20%的培养单位。信息与通信工程、仪器科学与技术、生物医学工程、光学工程等5个新兴学科也处于良好学科地位。

        原有的9个国家重点学科通过考评。新增和认定了4个一级学科国家重点学科，6个二级学科国家重点学科，2个二级学科国家重点（培育）学科，共涵盖23个二级学科。新增一级学科博士学位授权点10个,总数达到18个；新增二级学科博士学位授权点66个，总数达到107个；新增硕士学位授权点72个，总数达到147个。在新一轮辽宁省重点学科考评和重新申报中，原有26个重点学科全部通过考评。新增和认定了17个一级学科、8个二级学科省重点学科，共涵盖67个二级学科。

        在2002年第一轮全国一级学科整体水平评估中，水利工程和船舶与海洋工程两个学科均获得全国第3名，2007年第二轮全国一级学科(第一批)整体水平评估中，化学工程与技术、管理科学与工程一级学科列全国第3名。

        加强学科群建设，调整、优化了学科结构。成功组建了运载工程与力学学部。设置学科交叉基金，并先后支持了一批跨学科跨院系研究项目。